Pada Tahun Akademik 2016-2017, MTPBA menerima 13 mahasiswa baru. Jumlah ini merupakan jumlah paling sedikit dalam sejarah MTPBA. Ketigabelas mahasiswa baru terdiri dari 9 karyasiswa Kementerian PUPR, 1 Karyasiswa dari Pemerintaha Kota Balikpapan, dan 3 Mahasiswa AUN/SEED-Net dari Mahasiswa AUN/SEED-Net berasal dari Cambodia, Malaysia, dan Myanmar. Di Prodi MTPBA, mahasiswa yang masuk pada Tahun Akademik 2016-2017 merupakan mahasiswa Angkatan XVI.

Seperti mahasiswa baru UGM lainnya, para mahasiswa MTPBA Angkatan XVI mulai menempuh kuliah pada Senin, 8 Agustus 2016. Hari pertama kuliah, para mahasiswa diajak berkeliing kampus DTSL dan FT.